Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp13Q5BKP2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp13Q5BKP2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp13Q5BKP2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms