Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ndufaf2Q59J78 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ndufaf2Q59J78 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ndufaf2Q59J78 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms