Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srrm1Q52KI8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Srrm1Q52KI8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Srrm1Q52KI8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms