Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spire1Q52KF3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spire1Q52KF3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms