Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx49Q4FZF3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx49Q4FZF3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx49Q4FZF3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms