Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brinp3Q499E0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Brinp3Q499E0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brinp3Q499E0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms