Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc27Q3V036 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc27Q3V036 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc27Q3V036 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms