Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnpc3Q3UZ01 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnpc3Q3UZ01 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms