Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Clca4bQ3UW98 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Clca4bQ3UW98 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms