Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Skap1Q3UUV5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Skap1Q3UUV5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Skap1Q3UUV5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms