Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chpf2Q3UU43 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chpf2Q3UU43 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms