Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Thsd4Q3UTY6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms