Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkl5Q3UTQ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdkl5Q3UTQ8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkl5Q3UTQ8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms