Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.29■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
B230104I21RikQ3USW4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
B230104I21RikQ3USW4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B230104I21RikQ3USW4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms