Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Klhdc9Q3USL1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhdc9Q3USL1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhdc9Q3USL1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms