Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vwa5b2Q3UR50 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vwa5b2Q3UR50 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms