Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Mindy4Q3UQI9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Mindy4Q3UQI9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mindy4Q3UQI9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mindy4Q3UQI9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mindy4Q3UQI9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mindy4Q3UQI9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mindy4Q3UQI9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Mindy4Q3UQI9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy4Q3UQI9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy4Q3UQI9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Mindy4Q3UQI9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mindy4Q3UQI9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Mindy4Q3UQI9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Mindy4Q3UQI9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Mindy4Q3UQI9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Mindy4Q3UQI9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Mindy4Q3UQI9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mindy4Q3UQI9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms