Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prrc1Q3UPH1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prrc1Q3UPH1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms