Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Nlrc4Q3UP24 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrc4Q3UP24 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.5 ms