Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Skap2Q3UND0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Skap2Q3UND0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms