Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMT1

Ppp1r12c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r12cQ3UMT1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms