Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrxosQ3UL53 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrxosQ3UL53 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CrxosQ3UL53 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrxosQ3UL53 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrxosQ3UL53 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CrxosQ3UL53 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrxosQ3UL53 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrxosQ3UL53 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CrxosQ3UL53 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CrxosQ3UL53 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 219.6 ms