Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Edc4Q3UJB9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Edc4Q3UJB9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Edc4Q3UJB9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Edc4Q3UJB9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms