Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sf3b2Q3UJB0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sf3b2Q3UJB0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms