Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc34Q3UI66 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc34Q3UI66 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc34Q3UI66 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms