Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zswim8Q3UHH1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zswim8Q3UHH1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zswim8Q3UHH1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms