Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rapgef1Q3UHC1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rapgef1Q3UHC1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms