Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnrc6cQ3UHC0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tnrc6cQ3UHC0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms