Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trafd1Q3UDK1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trafd1Q3UDK1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms