Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pid1Q3UBG2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pid1Q3UBG2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms