Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trip13Q3UA06 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trip13Q3UA06 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms