Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q3U6N9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U6N9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U6N9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q3U6N9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U6N9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U6N9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q3U6N9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q3U6N9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q3U6N9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q3U6N9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Q3U6N9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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