Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hectd3Q3U487 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hectd3Q3U487 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms