Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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Hvcn1Q3U2S8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hvcn1Q3U2S8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Hvcn1Q3U2S8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Hvcn1Q3U2S8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Hvcn1Q3U2S8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hvcn1Q3U2S8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms