Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem35bQ3U0Y2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tmem35bQ3U0Y2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem35bQ3U0Y2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms