Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc9Q3U0M1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc9Q3U0M1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms