Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbxip1Q3TVI8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pbxip1Q3TVI8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pbxip1Q3TVI8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms