Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm21440Q3TTD8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21440Q3TTD8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms