Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
D17Wsu92eQ3TT38 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
D17Wsu92eQ3TT38 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
D17Wsu92eQ3TT38 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
D17Wsu92eQ3TT38 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
D17Wsu92eQ3TT38 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
D17Wsu92eQ3TT38 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
D17Wsu92eQ3TT38 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
D17Wsu92eQ3TT38 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
D17Wsu92eQ3TT38 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
D17Wsu92eQ3TT38 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms