Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Calr4Q3TQS0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Calr4Q3TQS0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms