Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc102aQ3TMW1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms