Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prrc2cQ3TLH4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prrc2cQ3TLH4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms