Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc27Q3TKY6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Cwc27Q3TKY6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cwc27Q3TKY6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cwc27Q3TKY6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cwc27Q3TKY6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cwc27Q3TKY6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cwc27Q3TKY6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cwc27Q3TKY6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cwc27Q3TKY6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cwc27Q3TKY6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cwc27Q3TKY6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cwc27Q3TKY6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cwc27Q3TKY6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cwc27Q3TKY6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cwc27Q3TKY6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms