Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
Smarca4Q3TKT4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Smarca4Q3TKT4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Smarca4Q3TKT4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Smarca4Q3TKT4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms