Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2afvQ3THW5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2afvQ3THW5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms