Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prr27Q3SYJ2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prr27Q3SYJ2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms