Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trpm1Q2TV84 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Trpm1Q2TV84 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Trpm1Q2TV84 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Trpm1Q2TV84 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms