Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vax1Q2NKI2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vax1Q2NKI2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms