Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrna5Q2MKA5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrna5Q2MKA5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chrna5Q2MKA5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms