Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm1123Q1RME4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm1123Q1RME4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm1123Q1RME4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm1123Q1RME4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm1123Q1RME4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm1123Q1RME4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm1123Q1RME4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm1123Q1RME4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm1123Q1RME4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm1123Q1RME4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm1123Q1RME4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm1123Q1RME4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm1123Q1RME4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm1123Q1RME4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm1123Q1RME4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm1123Q1RME4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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